Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PTGIRP43119 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms