Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms