Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
BMI1P35226 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
BMI1P35226 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BMI1P35226 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BMI1P35226 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BMI1P35226 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BMI1P35226 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BMI1P35226 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
BMI1P35226 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
BMI1P35226 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
BMI1P35226 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms