Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 297.9 ms