Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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HOXA13P31271 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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HOXA13P31271 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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HOXA13P31271 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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HOXA13P31271 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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