Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTGFP29279 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTGFP29279 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTGFP29279 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms