Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
DUSP1P28562 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms