Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGS1P23219 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms