Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PTPN1P18031 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PTPN1P18031 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms