Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ITGA4P13612 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms