Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFTRP13569 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFTRP13569 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFTRP13569 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFTRP13569 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CFTRP13569 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CFTRP13569 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CFTRP13569 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CFTRP13569 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFTRP13569 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFTRP13569 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFTRP13569 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFTRP13569 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFTRP13569 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFTRP13569 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFTRP13569 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFTRP13569 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFTRP13569 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFTRP13569 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CFTRP13569 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CFTRP13569 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms