Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL5P13501 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL5P13501 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL5P13501 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL5P13501 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL5P13501 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL5P13501 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL5P13501 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL5P13501 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL5P13501 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL5P13501 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL5P13501 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL5P13501 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL5P13501 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL5P13501 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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