Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNAP02545 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNAP02545 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNAP02545 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNAP02545 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNAP02545 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNAP02545 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNAP02545 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LMNAP02545 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LMNAP02545 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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