Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SKAP2O75563 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms