Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GOLGA8SH3BPF8 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms