Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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GGTLC3B5MD39 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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GGTLC3B5MD39 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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GGTLC3B5MD39 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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GGTLC3B5MD39 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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GGTLC3B5MD39 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
GGTLC3B5MD39 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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