Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms