Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPACA6W5XKT8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPACA6W5XKT8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPACA6W5XKT8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPACA6W5XKT8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPACA6W5XKT8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPACA6W5XKT8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SPACA6W5XKT8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPACA6W5XKT8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPACA6W5XKT8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPACA6W5XKT8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPACA6W5XKT8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SPACA6W5XKT8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPACA6W5XKT8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPACA6W5XKT8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPACA6W5XKT8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPACA6W5XKT8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPACA6W5XKT8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPACA6W5XKT8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPACA6W5XKT8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPACA6W5XKT8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPACA6W5XKT8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPACA6W5XKT8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPACA6W5XKT8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPACA6W5XKT8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPACA6W5XKT8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPACA6W5XKT8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms