Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms