Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N1

COX11, Cytochrome c oxidase assembly protein COX11, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX11Q9Y6N1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COX11Q9Y6N1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
COX11Q9Y6N1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms