Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PARP3Q9Y6F1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PARP3Q9Y6F1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PARP3Q9Y6F1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP3Q9Y6F1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP3Q9Y6F1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP3Q9Y6F1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP3Q9Y6F1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP3Q9Y6F1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP3Q9Y6F1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP3Q9Y6F1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP3Q9Y6F1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PARP3Q9Y6F1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PARP3Q9Y6F1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PARP3Q9Y6F1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PARP3Q9Y6F1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PARP3Q9Y6F1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PARP3Q9Y6F1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PARP3Q9Y6F1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PARP3Q9Y6F1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PARP3Q9Y6F1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PARP3Q9Y6F1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PARP3Q9Y6F1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
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