Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D9

MAD1L1, Mitotic spindle assembly checkpoint protein MAD1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAD1L1Q9Y6D9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MAD1L1Q9Y6D9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MAD1L1Q9Y6D9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MAD1L1Q9Y6D9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms