Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTLL3Q9Y4R7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTLL3Q9Y4R7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms