Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SH3BP1Q9Y3L3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SH3BP1Q9Y3L3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SH3BP1Q9Y3L3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms