Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
REXO2Q9Y3B8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
REXO2Q9Y3B8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms