Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
KLHDC2Q9Y2U9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHDC2Q9Y2U9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms