Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q5

LAMTOR2, Ragulator complex protein LAMTOR2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR2Q9Y2Q5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LAMTOR2Q9Y2Q5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMTOR2Q9Y2Q5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms