Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RCE1Q9Y256 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms