Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM50BQ9Y247 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM50BQ9Y247 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms