Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GNEQ9Y223 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GNEQ9Y223 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GNEQ9Y223 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms