Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQQ2

SH2B3, SH2B adapter protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B3Q9UQQ2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2B3Q9UQQ2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH2B3Q9UQQ2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH2B3Q9UQQ2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH2B3Q9UQQ2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH2B3Q9UQQ2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH2B3Q9UQQ2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH2B3Q9UQQ2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH2B3Q9UQQ2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SH2B3Q9UQQ2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms