Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ERVW-1Q9UQF0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ERVW-1Q9UQF0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVW-1Q9UQF0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms