Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SMC3Q9UQE7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SMC3Q9UQE7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SMC3Q9UQE7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms