Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SHANK2Q9UPX8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
SHANK2Q9UPX8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SHANK2Q9UPX8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SHANK2Q9UPX8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms