Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM33Q9UPN9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM33Q9UPN9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM33Q9UPN9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms