Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
L1RE1Q9UN81 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms