Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EPDR1Q9UM22 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EPDR1Q9UM22 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EPDR1Q9UM22 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EPDR1Q9UM22 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EPDR1Q9UM22 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EPDR1Q9UM22 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPDR1Q9UM22 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPDR1Q9UM22 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPDR1Q9UM22 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPDR1Q9UM22 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPDR1Q9UM22 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPDR1Q9UM22 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPDR1Q9UM22 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EPDR1Q9UM22 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms