Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF490Q9ULM2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF490Q9ULM2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF490Q9ULM2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 537.5 ms