Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG6

CCPG1, Cell cycle progression protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCPG1Q9ULG6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCPG1Q9ULG6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCPG1Q9ULG6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCPG1Q9ULG6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms