Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PADI1Q9ULC6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI1Q9ULC6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms