Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ITGA11Q9UKX5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ITGA11Q9UKX5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms