Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
ERG28Q9UKR5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ERG28Q9UKR5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms