Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PARP4Q9UKK3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PARP4Q9UKK3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PARP4Q9UKK3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms