Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CHIC2Q9UKJ5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CHIC2Q9UKJ5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms