Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA9

PTBP2, Polypyrimidine tract-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP2Q9UKA9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTBP2Q9UKA9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTBP2Q9UKA9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTBP2Q9UKA9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms