Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW8

ZNF180, Zinc finger protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF180Q9UJW8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF180Q9UJW8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZNF180Q9UJW8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms