Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MID2Q9UJV3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MID2Q9UJV3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms