Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TUBE1Q9UJT0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TUBE1Q9UJT0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TUBE1Q9UJT0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms