Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MBD1Q9UIS9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MBD1Q9UIS9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms