Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SFMBT1Q9UHJ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms